.jpg)
Текстовое описание вируса
- Название вируса: Dendrolimus punctatus densovirus
Описание генома из записи банка Refseq
- Идентификатор NCBI: NC_006555
- Содержание записи: последовательность полного генома вируса
- Длина последовательности: 5039 п.н.
Описание генов в геноме вируса
Таблица 1. Описание генов и кодируемых белков в геноме вируса.
| № | Ген | Начало гена в геноме | Конец гена в геноме | Направление | Длина гена, п.н. | Белок | Идентификатор белка | Длина белка, а.о. |
| 1 | NS1 |
328-ой
нуклеотид |
2655-ый нуклеотид | Прямое | 2328 | Неструктурный белок 1 | YP_164339.1 | 775 |
| 2 | NS2 |
494-ый
нуклеотид |
1855-ый нуклеотид | Прямое | 1362 | Неструктурный белок 2 | YP_164340.1 | 453 |
| 3 | VP |
2745-ый
нуклеотид |
4751-ый нуклеотид | Прямое | 2007 | Вирусный белок | YP_164341.1 | 668 |
Рис.1 Структура генома Dendrolimus punctatus densovirus (изображение увеличивается по клику)
Изображение получено с помощью геномного браузера NCBI
Рис.2 Область перекрывания двух генов (изображение увеличивается по клику).
Изображение получено с помощью геномного браузера NCBI
Полный геном вируса содержит три гена, закодированных на одной цепи РНК.
Ген, кодирующтий неструктурный белок 2 (YP_164340.1), находится внутри гена, кодирующего неструктурный белок 1 (YP_164339.1). На рис.2 видно, что рамка считывания неструктурного белка 2 сдвинута на 1 нуклеотид по сравнению с рамкой считывания неструктурного белка 1.
Ген, кодирующтий неструктурный белок 2 (YP_164340.1), находится внутри гена, кодирующего неструктурный белок 1 (YP_164339.1). На рис.2 видно, что рамка считывания неструктурного белка 2 сдвинута на 1 нуклеотид по сравнению с рамкой считывания неструктурного белка 1.